By 发表: 2018年5月3日

出生在科罗拉多大学博尔德校区, 琶音生物科学公司正在寻找人类基因组中以前未知的部分,以更好地了解药物和疾病


人类基因组充满了博彩平台推荐几乎完全不了解的“黑暗DNA”, 但科罗拉多大学博尔德校区的一家新成立的公司可能很快就会对它对健康的影响和可能的好处有所了解.

乔伊

乔伊Azofeifa

琶音生物科学, 这是博彩平台推荐计算机科学家和生物学家的心血结晶, 是在寻找基因组的“黑暗部分”吗, 几十年来,博彩平台推荐的基因构成领域一直被认为是“空白”.“博彩平台推荐的目标是更好地了解药物治疗对不同细胞的影响, 以及这种差异如何导致对药物究竟如何起作用的理解, 而是疾病是如何在体内发挥作用的.

博彩平台推荐可以将其简化为单一因素,乔伊·阿佐菲说, 最近从博彩平台推荐的计算机科学项目获得博士学位, 指的是在疾病状态下细胞的生化变化. “然后博彩平台推荐就有了治疗疾病的新目标. 然后博彩平台推荐可以围绕这些目标发展新公司,治愈这些疾病.”

在这三个人中.20亿个字母组成了博彩平台推荐的基因组, 只有1%编码蛋白质——博彩平台推荐细胞的机械组成部分. 科学家过去认为蛋白质是DNA中唯一有功能的部分, 因此,当得知蛋白质编码基因只占基因组的一小部分时,我感到很震惊. 这就像在夜空中寻找星星,却只注意到一片空白.

多亏了 最新进展然而,科学家们开始意识到,“空白区域”并不是那么没用. 虽然它可能看起来与夜空相似——大量的黑色空间和一些火花——但实际上更像是一个点缀着亮片的蹦床. 如果你碰到蹦床的表面, 这些亮片随着蹦床的弹跳而移动, 导致影响扩散,并在整个DNA中产生可见的变化.

Azofeifa通过研究所有生命的基本过程——转录——来研究基因组的“黑暗部分”.

在DNA变成蛋白质之前,它必须变成一种类似的分子,叫做RNA. 这个过程被称为转录,因为RNA和DNA使用相同的生物学“语言”(差异很小)。. 另一方面,当你将RNA“解读”到蛋白质中时,它就变成了一个非常不同的分子. 这个过程被称为翻译,因为你改变了分子的语言.

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Arpeggio的科学家Joel Basken和Maria Lai说. 礼貌的照片.

研究转录现象, Azofeifa加入了Robin 道尔在分子系的实验室, 在文理学院的细胞与发育生物学专业学习并利用了能够捕获细胞群中所有活跃转录的RNA的技术, 并在很短的时间内测量它们. 这些技术相对较新, 并且不同于过去用于研究任何给定时间细胞中存在的RNA的技术.

较老的技术(如RNA-seq)测量细胞内可以分离的所有RNA. 但他们通常需要更长的等待时间, 这意味着科学家将研究早在实验之前就产生的RNA. 据Azofeifa说, 如果科学家想研究对刺激的即时反应, 比如一种特殊的药物, 这些旧的技术并没有那么有用.

“问题是,如果你等上12或24小时, 很多已经改变的东西都是第二或第三和第四效应,亚佐菲法说. “所以,你并没有真正抓住药物的直接主要目标. 你在泳池里发现了你嗑药后的涟漪.”

在他的研究生工作中,Azofeifa利用了一种新的技术,叫做 g全球核 run-on seq基因测序,即GRO-Seq. GRO-Seq使科学家能够立即研究活跃转录的RNA. 通过这样做, 他展示了 从基因组的“黑暗区域”(永远不会变成蛋白质的RNA)产生的RNA可能比科学家们所怀疑的更多地揭示了细胞的活动.

现在, Azofeifa与他的研究生导师合作, 道尔, 以及另一位刚从道尔实验室毕业的学生, 蒂姆读, 使用GRO-Seq, 以及相关的PRO-Seq,以启动琶音生物科学. GRO-Seq和PRO-seq检测, 或者生物程序, 将允许Arpeggio研究RNA转录模式在不同情况下的变化方式, 比如药物治疗.

我认为像Arpeggio这样的公司源于这样一个事实,即领域之间的交叉产生了一些想法,如果没有这些交叉,这些想法就不会被构想出来."

虽然对药物治疗后的细胞进行RNA测序并不是一项新的生物技术, Azofeifa认为使用PRO-Seq, 以及他开发的用来分析结果的算法, 会给琶音带来优势吗.

博彩平台推荐基本上是一家RNA-Seq公司,拥有更好的分析和更好的算法,Azofeifa说, 笑.

琶音的概念, 一家结合尖端算法和生物学的公司, 诞生于无数次的阿唑非法, 计算机科学家, 和阅读, 一个生物学家, 他们在道尔实验室工作时聊起了“黑暗DNA”. 道尔认为这是创建一个跨学科实验室最好的事情之一.

“我认为像Arpeggio这样的公司源于这样一个事实,即不同领域之间的交集会产生一些想法,如果没有这些交集,这些想法就不会被构想出来,道尔说.

“我的实验室里有一张地图,上面写着‘跟着问题走’,因为这是我对待生活和一切事物的方式. 最好的想法往往来自于你从未接受过正式培训的东西, 但是其他人有, 然后你开始说话.”

Arpeggio的第一个客户是Forma Therapeutics这家肿瘤学公司试图了解他们的药物对细胞产生了什么变化. Arpeggio的科学家将检查治疗前后RNA转录的位置,试图了解这些药物是如何影响基因组中不编码蛋白质的区域的.

长期, Azofeifa希望运用Arpeggio的方法来了解疾病是如何在人体内运作的. 虽然这个雄心勃勃的目标可能还需要一段时间, Azofeifa相信Arpeggio是做这件事的合适公司, 他们在正确的地方做这件事.

“能从这样一个地方开始,我感到非常感激,”Azofeifa说. “博彩平台推荐是一家RNA公司,这里是研究RNA的好地方. 科罗拉多大学为博彩平台推荐提供了很多智力支持.“

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